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  • 一种信息学算法快速筛选肿瘤特异抗原的方法

    中国教育装备采购网2013-04-23 14:17围观1695次我要分享

      近日,由北京大学医学部免疫学系的研究人员和美国贝勒医学院合作,在筛选肿瘤特异抗原方面取得重要成果。最新代表性研究论文于近日在线发表在《癌症研究》(Cancer Research)上。

      肿瘤特异抗原(Tumor-specific antigen, TSA)具有在正常组织低表达,而在肿瘤组织中高表达的特点,对肿瘤的早期诊断和肿瘤免疫治疗都十分关键。部分肿瘤特异抗原被证明能有效诱导体内免疫应答,在肿瘤疫苗的研制中有重要价值。

      筛选肿瘤特异抗原的传统方法包括抑制性删减杂交(SSH)和重组cDNA表达文库的血清学分析(SEREX)等,实验周期较长,且成本偏高。该研究团队首先采用生物信息学策略筛选肿瘤特异抗原,通过分析在临床上已经得到认可的肿瘤特异抗原的表达谱特点,开发出一套独特的算法HEPA(heterogeneous expression profile analysis),能有效从基因组中筛选出肿瘤中高表达的基因,并用实验方法进行验证,初步得到19个肿瘤特异抗原。研究人员随后开发了一种新的筛选血清中抗体的方法PARSE (Protein A/G based reverse serum ELISA) ,用以检测肿瘤患者血清中针对肿瘤特异抗原的自身特异性抗体。通过PARSE方法,研究人员发现在4~11的肺癌患者血清中,有针对四个新肿瘤抗原的自身特异性抗体,而在健康人血清中罕见。在两组独立的肺癌病人血清中,四种自身特异性抗体的联合ROC曲线下面积均达0.71以上,提示可以作为诊断肺癌的联合标志物。

      该研究提供了从分析肿瘤特异抗原表达谱特点入手,开发信息学算法快速筛选肿瘤特异抗原,到表达谱验证,检测肿瘤患者体液免疫反应阳性率,再到肿瘤标志物联合诊断的一套完整思路,对肿瘤的早期诊断和肿瘤疫苗的研制都具有重要参考价值。

      对外承揽试验:免疫组化,荧光,Tunel,Elisa,WB,

      原位杂交,比色法,HE染色,特染,图像分析,欢迎咨询!

    来源:北京雅安达生物技术有限公司作者:北京雅安达生物技术有限公司
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