Geneious是一款综合、跨平台的生物信息学软件,包括操作、发现、共享和探索生物数据,例如DNA序列或蛋白质,系统进化,三维结构信息,出版文献等。它的功能包括序列对比和系统学分析,毗连群,引物设计和克隆和限制性分析,使用NCBI和EMBL, BLAST,蛋白质结构查看,自动化医学搜索等。它甚至包含了一个API,您可以创建您的个人生物信息学插件。
序列分析
共有序列,DNA与蛋白质的转换和补充。
双序列与多重序列分析选择,包括ClustalW, MUSCLE, 进成对和翻译对齐。
用NJ 、bootstrapping、一致树和PAUP ,MrBayes插件创建进化树。
即时更新共有序列,翻译,补充和蛋白质分析。
查找图案,开放阅读框(ORFs)。
实验室序列分析
自动整理毗连群集合,载体的筛选,集合和色谱编辑。
454进口和装配参考,可以支持查看大型的数据集。
限制和通路克隆,限制映射,消化和连接。
用简并支持就可以自动设计引物。
保持引物数据库并搜索适合新序列的引物。
序列可视化
可定制的图形浏览器和序列编辑器,校准和注解。
互动的,可定制的质粒地图。
系统进化树浏览器可定制的布局,颜色和样式。
图形的即时更新,包括序列标识,色谱痕迹和蛋白质属性。
三维蛋白质结构查看。
快速,互动的点图。
简单、高质量的图像输出。
组织和共享数据库
在一处地方保存和组织您所有的科研材料,包括序列,出版物和进化树等。
广泛的文件输入和输出,包括Vector NTI, Nexus, GenBank, Fasta, PDF,ABI等等。
在安全的中央服务器上合并和共享网络数据。
根据序列相似性、排序、基本和高级的文本来检索和分类数据。
为序列, 对齐 和系统树加入您自己的定制的注释。
进入公共数据库
从NCBI(包括基因,基因体,核苷酸,单核苷酸多态性,结构和蛋白质)拖放序列。
双击鼠标查询NCBI BLAST序列。
保持您的NCBI和EMBL及时下载自动更新。
与Pfam数据库紧密整合。
公共数据迅速下载,高效过滤。
生物信息学教学
Geneious直接连接材料创建互动教程。
只需单击鼠标就可以使用所有的生物信息工具。
学生可以回答问题,进行分析并使用Collaboration提交其结果。
资料管理
自动检索最新发表的文章,并可以根据您的兴趣自动给新发表文章分类。
保存摘要和书目信息。
快速连接到网络上的原始文章和引用记录。