本文由中国科学软件网翻译整理
PC-ORD多元生态数据分析软件
PC-ORD主要是关于生物逻辑的。它已经在生物周刊上发表了包括图表和多重变量在内的5000多篇文章。
PC-ORD使生态数据的多元分析进入到电子表格中。我们强调的是非参数工具，图形化的表述，并对群落数据分析的随机测试。除了转换数据和管理文件的工具外，PC-ORD 提供了许多在其他主要统计软件包里面不包含的排序和分类技术，包括：CCA，DCA，MRPP，perMANOVA，双向聚类，TWINSPAN, Beals 平滑，多样性指数，物种清单，Mantel测试，统筹叠加方法(定量，符号编码，彩色编码，网格，联合绘图，双标图，连续矢量)，各种旋转方式，三维排序图形，指标物种分析，Bray-Curtis排序，城市街区距离测量，物种区域曲线，树木数据摘要，出版品质的聚类分析，自动导航模式的 NMS。还可以分析大型数据集。只要您的电脑里面有足够的内存, 您就可处理矩阵数据达32,000 行或32,000 列, 矩阵元最高达536,848,900.
PC-ORD 功能亮点
图表
• 三维排列
• 用于幻灯片或网页的三维动态图片
• 双向聚类树图
• 有序的矩阵(按序列分数排序)
• 散布图矩阵
• 简易的散布图分析
• 显性多样性曲线和频繁的绘图
• 频率分布(分散的，连续的，密度估计)
• 丛神经覆盖排列
图形质量提高
• 把连续矢量还原(强光绘图)
• 把矢量转换为原始值并设单位长度
• PCA双标图矢量(为物种计算或以距离为基础的双标图绘图或其他变量)
• 把图片保存为JPEG格式
• 把符号类型增加到最大化或单一图片色彩从15调整到32位
• 设置图片分辨率按百分比预览以保存或粘帖
• 有定位内部，外部或交叉轴设置的选项
• 点的象限灵敏度标签排列
• 联合绘图，双标图，连续矢量的操作箭头和箭头大小的选项
• 通过Gaussian kernel平滑对侧面包络散点图的改善
分析
• 单向的，阶乘的，嵌套和组块的形式设计以排列为基础的MANOVA (PerMANOVA)
• 双向聚类分析
• 展示最重要的数据集的特征摘要
• 用密度估算技术计算平滑的单变量频率分布
• 物种联合以2*2列联表
向导
• 在决策树的基础上帮助您决定如何分析您的数据
• 也可作为自学工具使用
数据管理和抽样
• 输入和输出Excel文件
• 同时调整主要和次要的矩阵(如: 同时删除两个矩阵中的列)
• 通过主要和次要矩阵中的标准变量来过滤列
• 允许对第二个矩阵直接进行修改
• 允许命名更长的文件名
• 扩展矩阵(增加行和列的匹配)
已有分析的附加功能
• PCA随机测试
• 直接对远距离矩阵进行聚类分析
• 在等级相关或秩转化的距离矩阵基础上进行Mantel测试
• 把远距离矩阵编写成电子表格或者文本文件，全矩阵或成对列表
• 把NMS数据存为文本文件，电子表格或结果文件
• 由第二个矩阵中的一个变量来分解行和列的摘要。
软件功能介绍
图表
• 反射/旋转排列
• 叠加的侧面绘图适合包络分析
• 用于聚类分析的树状图
• 物种面积曲线
• 物种面积曲线的置信带
• NMS的陡坡图
输入/输出
• 输入/输出Excel文件和Excel 2007文件
• 把分数输出到电子表格中
• 把分数加到第二个矩阵中
• 输入/输出数据库格式
PC-ORD特有的特征
• CCA
• NMS 自动导航模式 (NMDS)
• NMS预测模式 (NMDS)
• PerMANOVA
• 指示种分析 (Dufrêne & Legendre)
• DCA (DECORANA)
• TWINSPAN
• 双向聚类分析 (biclustering)
• MRPP
• Blocked MRPP
• 物种面积曲线
• 多样性标记
• 物种名单
• Mantel测试
• 多样循环方式
• 三维排列图表
• 出版质量的树状图
• 排列覆盖方式：带符号和颜色编码的定量, 网格, 联合图形, 双标图和连续矢量
• Bray-Curtis (Polar) 排列
• 街区距离测量
• 树型数据摘要
• NMS, BC, PCA的物种排列
• Beals平滑
• 物种按群分组
• 修改成适合生态学的术语
总结
• 优秀的生态学教学助手
• 编辑矩阵电子表格
