微生物(microorganism)，包括细菌、病毒、真菌以及些小型的原生动物等在内的大类生物群体，个体微小，与人类生活密切相关。广泛涉及健康、药、农业、环保等诸多域。在中大陆地区的教科书中，均将微生物划分为以下8大类：细菌、病毒、真菌、放线菌、立克次体、支原体、衣原体、螺旋体。
点介绍
个体微小，般<0.1mm。
构简单，有单细胞的，简单多细胞的，非细胞的。化地位低，大多依靠有机物维持生命
基本分类
原核类：三菌，三体。
三菌：细菌、蓝细菌、放线菌三体：支原体、衣原体、立克次氏体。
真核类: 真菌，原生动物，显微藻类。
非细胞类： 病毒，亚病毒( 类病毒，拟病毒，朊病毒)。
类群种类
原核：细菌、放线菌、螺旋体、支原体、立克次氏体、衣原体。
真核：真菌、藻类(分)、原生动物(分)。
非细胞类：病毒和亚病毒。
般地，在中大陆地区的教科书中，均将微生物划分为以下8大类：
细菌、病毒、真菌、放线菌(广义上属于细菌的种)、立克次体、支原体、衣原体、螺旋体。[1]
细菌
(1)定义：类细胞细短，结构简单，胞壁坚韧，多以二分裂方式繁殖和水生性强的原核生物。
(2)分布:温暖，潮湿和富含有机质的地方。
(3)结构：主要是单细胞的原核生物，有形，杆形，螺旋形。
基本结构：细胞膜细胞壁细胞质核质。
殊结构：荚膜、鞭毛、菌毛、芽胞。
(4)繁殖: 主要以二分裂方式行繁殖的。
(5)菌落： 单个细菌用肉眼是看不见的，当单个或少数细菌在固体培养基上大量繁殖时，便会形成个肉眼可见的，具有定形态结构的子细胞群落。
菌落是菌种鉴定的重要依据。不同种类的细菌菌落的大小，形状光泽度颜色硬度透明度都不同。
放线菌
(1)定义:类主要成菌丝状生长和以孢子繁殖的陆生性较强的原核生物
(2)分布：含水量较低，有机物较丰富的，呈微碱性的土壤中。
(3)形态构:主要由菌丝组成，包括基内菌丝和气生菌丝(分气生菌丝可以成熟分化为孢子丝，产生孢子) 。
(4)繁殖：通过形成无性孢子的形式行无性繁殖
无性繁殖有性繁殖。
(5)菌落:在固体培养基上：干燥，不透明，表面呈致密的丝绒状，彩色干粉。[2]
病毒
(1) 定义:类由核酸和蛋白质等少数几种成分组成的“非细胞生物”，但是它的生存依赖于活细胞。
(2)结构：[font class="Apple-style-span" style="font-family: -webkit-monospace; font-size: 13px; line-height: normal; white-space: pre-wrap; "]蛋白质衣壳以及核酸(核酸为DNA或RNA)[/font]。
(3)大小：般直径在100nm左右，大的病毒直径为200nm的牛痘病毒，小的病毒直径为28nm的脊髓灰质炎病毒。
(4)增殖:病毒的生命活动中
个显著的点为寄生性。病毒只能寄生在某种定的活细胞内才能生活。并利用宿主细胞内的环境及原料快速复制增值。在非寄生状态时呈结晶状，不能行立的代谢活动。以噬菌体为例： 吸附→DNA注入→复制、合成→组装→释放。
微生物的化学组成
C、H、O、N、P、S以及其他元素。
微生物的营养物质
1 水和无机盐
2 碳源:凡能为微生物提供生长繁殖所需碳元素的营养物质。
来源：周围环境中的有机物质，常用的有糖类、油脂、有机酸及有机酸酯和小分子醇。
作用：碳源对微生物生长代谢的作用主要为提供细胞的碳架，提供细胞生命活动所需的能量，提供合成产物的碳架。
3氮源：凡能为微生物提供所需氮元素的营养物质。
来源：周围环境中得有机无机含氮物质。
作用:主要用于合成蛋白质，核酸以及含氮的代谢产物。
4能源:能为微生物生命活动提供初能源来源的营养物质或辐射能。
5生长因子：微生物生长不可缺少的微量有机物[1]
病源微生物
能引起人和动物致病的微生物叫病源微生物，有八大类：
1.真菌：引起皮肤病。深组织上感染。
2放线菌：皮肤，伤口感染。
3螺旋体：皮肤病，血液感染 如梅毒，钩端螺旋体病。
4细菌：皮肤病化脓，上呼吸道感染，泌尿道感染，食物中毒，败血压症，急性传染病等。
5立克次氏体：斑疹伤寒等。
6衣原体：沙眼，泌尿生殖道感染。
7病毒：肝炎，乙型脑炎，麻疹，艾滋病等。
8支原体：肺炎，尿路感染。
生物界的微生物达几种，大多数对人类有益，只有少份能致病。有些微生物通常不致病，在定环境下能引起感染称条件致病菌。 能引起食品变质，腐败，正因为它们分解自然界的物体，才能成大自然的物质循环
五大共性
体积小，面积大;
吸收多，转化快;
生长旺，繁殖快;
适应强，易变异;
分布广，种类多。
大小
目前界上已知大的微生物：1985年Fishelson、Montgomery及Myrberg三人发现种生长于红海水域中的热带鱼(名叫surgeonfish)的小肠管道中的微生物，这是当时界上所发现大的微生物。它外形酷似雪茄烟，长约200～500μm，长可达600μm，体积约为大肠杆菌的100倍，这种微生物并不需要由显微镜观察便可直接由肉眼察觉到它的存在。目前大的微生物则是1997年，由。Heidi Schulz在纳米比亚海岸海洋沉淀土中所发现的呈状的细菌，直径约100～750μm。这比之前所提的微生物大上100倍。
目前界上已知小的微生物：支原体，过去也译成“霉形体”，它是类介于细菌和病毒之间的单细胞微生物。地上已知的能立生活的小微生物，大小约为100纳米。支原体般都是寄生生物，其中有名的当属肺炎支原体(M.Pneumonia)，它能引起哺乳动物别是牛的呼吸器官发生严重病变
生物作用
微生物对人类重要的影响之是导致传染病的流行。在人类疾病中有50%是由病毒引起。界卫生组织公布资料显示：传染病的发病率和病死率在所有疾病中占据位。微生物导致人类疾病的历史，也就是人类与之不断斗争的历史。在疾病的预防和治疗方面，人类取得了长足的展，但是新现和再现的微生物感染还是不断发生，像大量的病毒性疾病直缺乏有效的治疗药物。些疾病的致病机制并不清楚。大量的广谱抗生素的滥用成了强大的选择压力，使许多菌株发生变异，导致耐药性的产生，人类健康受到新的威胁。些分节段的病毒之间可以通过重组或重配发生变异，典型的例子就是流行性感冒病毒。每次流感大流行流感病毒都与前次导致感染的株型发生了变异，这种快速的变异给疫苗的和治疗成了很大的障碍。而耐药性结核杆菌的出现使原本已近控制住的结核感染又在界范围内猖獗起来。
微生物千姿百态，有些是腐败性的，即引起食品气味和组织结构发生不良变化。当然有些微生物是有益的，它们可用来如奶酪，面包，泡菜，啤酒和葡萄酒。微生物非常小，通过显微镜放大约1000 倍才能看到。比如中等大小的细菌，1000个叠加在起只有句号那么大。想像下滴牛奶，每毫升腐败的牛奶中约有5千个细菌，或者讲每夸脱牛奶中细菌总数约为50亿。也就是滴牛奶中可能含有50 亿个细菌。
微生物能够致病，能够成食品、布匹、皮革等发霉腐烂，但微生物也有有益的面。早是弗莱明从青霉菌抑制其它细菌的生长中发现了青霉素，这对药界来讲是个划时代的发现。后来大量的抗生素从放线菌等的代谢产物中筛选出来。抗生素的使用在二次界大战中挽救了无数人的生命。些微生物被广泛应用于业发酵，乙醇、食品及各种酶制剂等;分微生物能够降解塑料、处理废水废气等等，并且可再生资源的潜力大，称为环保微生物;还有些能在端环境中生存的微生物，例如：温、低温、盐、碱以及辐射等普通生命体不能生存的环境，依然存在着分微生物等等。看上去，我们发现的微生物已经很多，但实际上由于培养方式等手段的限制，人类现今发现的微生物还只占自然界中存在的微生物的很少分。
微生物间的相互作用机制也相当奥秘。例如健康人肠道中即有大量细菌存在，称正常菌群，其中包含的细菌种类达上百种。在肠道环境中这些细菌相互依存，互惠共生。食物、有毒物质甚至药物的分解与吸收，菌群在这些过程中发挥的作用，以及细菌之间的相互作用机制还不明了。旦菌群失调，就会引起腹泻。
随着学研究入分子水平，人们对基因、遗传物质等业术语也日渐熟悉。人们认识到，是遗传信息决定了生物体具有的生命征，包括外形态以及从事的生命活动等等，而生物体的基因组正是这些遗传信息的携带者。因此阐明生物体基因组携带的遗传信息，将大大有助于揭示生命的起源和奥秘。在分子水平上研究微生物病原体的变异规律、毒力和致病性，对于传统微生物学来说是场革命。
从分子水平上对微生物行基因组研究为探索微生物个体以及群体间作用的奥秘提供了新的线索和思路。为了充分开发微生物(别是细菌)资源，1994年美发起了微生物基因组研究计划(MGP)。通过研究整的基因组信息开发和利用微生物重要的能基因，不仅能够加深对微生物的致病机制、重要代谢和调控机制的认识，更能在此基础上发展系列与我们的生活密切相关的基因程产品，包括：接种用的疫苗、治疗用的新药、诊断试剂和应用于农业的各种酶制剂等等。通过基因程方法的改，促新型菌株的构建和传统菌株的改，面促微生物业时代的来临。
业微生物涉及食品、制药、冶金、采矿、石油、皮革、轻化等多种行业。通过微生物发酵途径抗生素、丁醇、维生素C以及些风味食品的制备等;某些殊微生物酶参与皮革脱毛、冶金、采油采矿等过程，甚至直接作为洗衣粉等的添加剂;另外还有些微生物的代谢产物可以作为天然的微生物杀虫剂广泛应用于农业。通过对枯草芽孢杆菌的基因组研究，发现了系列与抗生素及重要业用酶的产生相关的基因。乳酸杆菌作为种重要的微生态调节剂参与食品发酵过程，对其行的基因组学研究将有利于找到关键的能基因，然后对菌株加以改，使其更适于业化的过程。内维生素C两步发酵法过程中的关键菌株氧化葡萄糖酸杆菌的基因组研究，将在基因组测序成的前提下找到与维生素C相关的重要代谢能基因，经基因程改，实现新的程菌株的构建，简化步骤，降低成本，继而实现经济效益的大幅度提升。对业微生物开展的基因组研究，不断发现新的殊酶基因及重要代谢过程和代谢产物生成相关的能基因，并将其应用于以及传统业、艺的改，同时推动现代生物的迅速发展。
经济作物柑橘的致病菌是际上个发表了序列的植物致病微生物。还有些在分类学、生理学和经济价值上非常重要的农业微生物，例如：胡萝卜欧文氏菌、植物致病性假单胞菌以及中正在开展的黄单胞菌的研究等正在行之中。日前植物固氮根瘤菌的序列也刚刚测定成。借鉴已经较为成熟的从人类病原微生物的基因组学信息筛选治疗性药物的方案，可以尝试性地应用到植物病原体上。别像柑橘的致病菌这种需要昆虫媒介才能成生活周期的种类，除了杀虫剂能阻断其生活周期以外，只能通过遗传学研究找到毒力相关因子，寻找抗性靶位以发展更有效的控制对策。固氮菌遗传信息的解析对于开发利用其固氮关键基因提农作物的产量和质量也具有重要的意义。
在端环境下能够生长的微生物称为端微生物，又称嗜菌。嗜菌对端环境具有很强的适应性，端微生物基因组的研究有助于从分子水平研究限条件下微生物的适应性，加深对生命本质的认识。
有种嗜菌，它能够暴
露于数千倍强度的辐射下仍能存活，而人类个剂量强度就会死亡。该细菌的染色体在接受几百拉德a射线后粉碎为数百个片段，但能在天内将其恢复。研究其DNA修复机制对于发展在辐射污染区行环境的生物治理非常有意义。开发利用嗜菌的限性可以突破当前生物域中的些局限，建立新的手段，使环境、能源、农业、健康、轻化等域的生物能力发生革命。来自端微生物的端酶，可在端环境下行使能，将大地拓展酶的应用空间，是建立效率、低成本生物过程的基础，例如PCR中的TagDNA聚合酶、洗涤剂中的碱性酶等都具有代表意义。端微生物的研究与应用将是取得现代生物优势的重要途径，其在新酶、新药开发及环境整治方面应用潜力大。[3]
折叠编辑本段生物贡献
现代生物学的若干基础性的重大发现与理论，是在研究微生物的过程中或以微生物为实验材料与具取得的。这些理论包括：证明DNA(脱氧核糖核酸)是遗传信息的载体(三大经典实验：肺炎菌的转化实验、噬菌体实验、植物病毒的重组实验)。DNA的半保留复制方式(双螺旋的每条子链分别、都是复制模板)。遗传密码子的解读(64个密码子各对应20种氨基酸及终止信号的哪种)。基因的转录调节(operon, promoter, operator, repressor, activator的概念与调节方式)。信使RNA的翻译调节(terminator)等等……。现在，很多常用、通用的生物学研究依赖于微生物，比如：分子克隆重组蛋白在细菌或酵母中的表达。很多学也依赖于微生物，比如：以病毒为载体的基因治疗
基因因素
农业微生物基因组研究认清致病机制发展控制病害的新对策。据资料统计，每年因病害导致的农作物减产可达20%，其中植物的细菌性病害为严重。除了培植在遗传上对病害有抗性的品种以及加强园艺管理外，似乎没有的病害防治策略。因此积开展某些植物致病微生物的基因组研究，认清其致病机制并由此发展控制病害的新对策显得十分紧迫。经济作物柑橘的致病菌是际上个发表了序列的植物致病微生物。还有些在分类学、生理学和经济价值上非常重要的农业微生物，例如：胡萝卜欧文氏菌、植物致病性假单胞菌以及我正在开展的黄单胞菌的研究等正在行之中。
微生物能够分解纤维素等物质，并促资源的再生利用。对这些微生物开展的基因组研究，在深入了解殊代谢过程的遗传背景的前提下，有选择性的加以利用，例如找到不同污染物降解的关键基因，将其在某菌株中组合，构建效能的基因程菌株，菌多用，可同时降解不同的环境污染物质，大发挥其改善环境、排除污染的潜力。美基因组研究所结合生物芯片方法对微生物行了殊条件下的表达谱的研究，以期找到其降解有机物的关键基因，为开发及利用确定目标。端环境微生物基因组研究深入认识生命本质应用潜力大。在端环境下能够生长的微生物称为端微生物，又称嗜菌。嗜菌对端环境具有很强的适应性，端微生物基因组的研究有助于从分子水平研究限条件下微生物的适应性，加深对生命本质的认识。有种嗜菌，它能够暴露于数千倍强度的辐射下仍能存活，而人类个剂量强度就会死亡。该细菌的染色体在接受几百拉德a射线后粉碎为数百个片段，但能在天内将其恢复。研究其DNA修复机制对于发展在辐射污染区行环境的生物治理非常有意义。开发利用嗜菌的限性可以突破当前生物域中的些局限，建立新的手段，使环境、能源、农业、健康、轻化等域的生物能力发生革命。来自端微生物的端酶，可在端环境下行使能，将大地拓展酶的应用空间，是建立效率、低成本生物过程的基础，例如PCR中的TagDNA聚合酶、洗涤剂中的碱性酶等都具有代表意义。端微生物的研究与应用将是取得现代生物优势的重要途径，其在新酶、新药开发及环境整治方面应用潜力大
