培训时间：2017年12月27-29日（周三至周五）
培训地点：苏州创腾科技培训中心（江苏省苏州市工业园区东长路88号2.5产业园A2栋301室）
►培训主旨：
本次培训班旨在帮助学员快速了解并掌握Discovery Studio2017R2中多种经典的模拟技术——同源建模、分子对接、药效团模型、蛋白设计，包括核心原理、参数设置技巧、结果分析、热点问题的解决并快速上机操作。
►培训对象：
从事药物研发相关领域的科研工作者，从事蛋白质结构与功能关系研究相关领域的科研工作者，对分子模拟和Discovery Studio软件感兴趣、希望系统掌握软件使用技巧、能够快速上机模拟操作相关课题的老师和同学。
►培训内容：
本次培训课程将会围绕Discovery Studio2017R2软件中多种小分子对接算法、全方位的药效团模型构建方法及应用策略、基于目前市场上最大最全药效团模型数据库的反向找靶、基于行业标准同源建模程序的蛋白结构预测与分析、以及业内认可度和使用率最高的蛋白对接方法、独特灵活的蛋白虚拟氨基酸突变等技术方法展开介绍。
►培训形式：
�1、通过文献案例分析讲解每一种模拟技术方法的应用以及原理介绍；
� 2、上机操作：讲解每一种模拟技术方法的具体操作流程及参数设置（提供完整的培训教程）；
� 3、学员交流与讨论，工程师进行现场答疑答疑。
►课程安排：
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日 期 |
时 间 |
内 容 |
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第一天 |
08:00-09:00 |
报到和注册 |
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报到地点：江苏省苏州市工业园区东长路88号2.5产业园A2栋301室 |
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09:00-10:45 |
Discovery Studio基本界面 |
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DS背景介绍，DS界面介绍，蛋白与小分子的预处理方法介绍与入门操作 |
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10:45-11:00 |
茶歇 |
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11:00-12:00 |
蛋白质三维结构的预测-同源建模MODELER |
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同源建模核心原理介绍，同源模板的选取技巧等。 |
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12:00-13:30 |
午餐 |
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13:30-15:00 |
蛋白质三维结构的预测-同源建模MODELER |
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同源建模参数设置讲解、实际操作技巧及结果分析。 |
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15:00-15:15 |
茶歇 |
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15:15-17:15 |
蛋白-小分子对接LibDOCK |
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分子对接的核心与原理，蛋白活性位点定义方法，分子对接结果的分析，最优对接构象的选取方法，LibDOCK的原理等； |
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LibDOCK参数设置技巧、实际操作技巧及结果分析。 |
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17:15-18:00 |
课程讨论及答疑 |
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第二天 |
09:00-10:30 |
蛋白-小分子对接LigandFit |
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分子对接算法的选取方法，打分函数的选取方法， LigandFit的原理及蛋白活性位点定义方法、参数设置技巧、实际操作技巧等。 |
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10:30-10:45 |
茶歇 |
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10:45-12:00 |
蛋白-小分子对接CDOCKER |
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关键氨基酸的识别与显示方法，作用机理的解释手段，CDOCKER原理介绍、参数设置技巧和实际操作技巧等。 |
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11:45-13:30 |
午餐 |
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13:30-15:00 |
蛋白-小分子对接Flexible Docking |
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对接过程中蛋白分子柔性的考虑方法，Flexible Docking原理介绍、参数设置技巧和实际操作技巧等。 |
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15:00-15:15 |
茶歇 |
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15:15-17:15 |
蛋白-蛋白/核酸/多肽分子对接ZDOCK |
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大分子对接，蛋白-蛋白/核酸/多肽结合模式的确定，结合表面关键残基的分析，原理介绍、案例分析、参数设置、实际操作技巧及结果分析。 |
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17:15-18:00 |
课程讨论及答疑 |
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第三天 |
9:00-10:30 |
蛋白设计：蛋白虚拟氨基酸突变 |
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突变位点、突变组合的建议以提高蛋白复合物亲和力或者提高蛋白的热稳性，pH和温度等环境因素的考虑，原理介绍、参数设置、实际操作技巧及结果分析 |
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10:30-10:45 |
茶歇 |
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10:45-12:00 |
药效团模型的构建及应用-定性药效团模型的构建HipHop |
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经典的基于配体的药物设计方法，训练集分子的选取依据，药效团模型的评价方法，基于药效团的药物虚筛方法。Hiphop参数设置技巧、实际操作技巧及结果分析。 |
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12:00-13:30 |
午餐 |
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13:30-15:00 |
药效团模型的构建及应用-定量药效团模型的构建HypoGen |
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经典的基于配体的药物设计方法，训练集分子的选取依据，药效团模型的评价方法。HypoGen参数设置技巧、实际操作技巧及结果分析。 |
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15:00-15:15 |
茶歇 |
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15:15-16:15 |
药效团模型的构建及应用-基于靶标结构的药效团模型构建SBP |
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SBP方法的原理、实际操作方法。 |
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16:15-17:15 |
药效团模型的构建及应用-基于受体-配体复合物的药效团模型构建CBP |
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基于药效团模型数据库ＰharmaDB的反向找靶 |
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CBP方法的原理及操作，反向找靶的策略，基于药效团反向找靶的结果分析，靶标的确认方法等。 |
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17:15-18:00 |
课程讨论及答疑 |
►网站报名：请点击此处，欢迎感兴趣的老师和同学踊跃报名。名额有限，报名从速！
