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SimGlycan多糖质谱数据分析软件

SimGlycan多糖质谱数据分析软件

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品  牌:PremierBiosoft
产品型号:4.0
所在地区:华北 北京
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详细说明

SimGlycan多糖质谱数据分析软件
 

SimGlycan多糖质谱数据分析软件主要功能特点:

  • 通过特有的排序和得分算法,将多糖的MS/MS数据与数据库中22400多个多糖图谱进行匹配。
  • 可以使用多糖和糖蛋白的ID号、序列、成分或质量对数据库进行检索
  • 参照其它的生物信息,预测可能的多糖结构,如多糖的分类、反应、路径和酶
  • 通过确定肽段部分的序列和质量,还可以进行糖基化肽的结构分析
  • 可使用还原末端修饰的化学衍生物搜索多糖,即使在程序的数据库里没有这些衍生物
  • 支持多价离子产生的串联质谱数据
  • 产生完整注释的2D多糖结构视图
  • 查看糖苷和跨环碎片(cross ring fragments)及其质量和质核比值
  • 采用Domon和Costello命名法产生理论碎片
  • 随多糖信息发布持续更新数据库
  • 兼容ABI质谱仪(TripleTOF™ 5600 System, TOF/TOF 5800, 4800 Plus MALDI TOF/TOF™ Analyzer, 4000 QTRAP® 和QSTAR® Elite Systems);兼容赛默飞世尔质谱仪(LTQ FT Ultra, LTQ Velos, LTQ XL, LTQ Orbitrap Discovery, LTQ Orbitrap Velos, LTQ Orbitrap XL, MALDI LTQ Orbitrap);兼容沃特世质谱仪(SYNAPT G2 HDMS, SYNAPT G2 MS, Xevo G2 QTof, Xevo QTof MS, Xevo TQ MS 和Xevo TQ-S platforms)


强大的多糖和糖肽数据库

SimGlycan 数据库是一个巨大的关系数据库,包含22,456种多糖、22814种糖肽、11,438种已知生物来源的多糖、11,918种已知分类的多糖、 263种生物化学反应、194种生化通路、250种酶相关多糖和9521个其他数据库链接。随着其他多糖信息的公布,数据库不断更新。

产生注释的图谱

SimGlycan 突出符合理论裂解的实验质核比值,产生描述连续单糖单位减少的注释的图谱。这有助于研究者建立支链类型,验证多糖的基本单位。每个峰可 用动画或Domon Costello命名法代表。可产生适合页面大小或基于目标区域的定制化的注释图谱,输出并与他人分享。简单的界面可以放大进入特定图位,指定质核比范围 来显示特定的图谱部分,也可以以图像文件输出到MS PowerPoint。SimGlycan多糖质谱数据分析软件

用户绘制结构

SimGlycan 允许用户绘制和编辑多糖和糖肽。单糖、肽链或如HSO3和Etn的取代基可以添加或删除,分支点和端基连接(anomeric linkage)可点击按键来修饰。每步,绘制结构的裂解使用户可以比较实验和理论数据,用户可见该修饰是否使理论上的多糖更接近于实验数据。这一功能对 解析多糖结构有很大帮助,特别是在没有目标多糖数据的情况下。

精确的多糖排序

基于我们专有的研究和评分机制对所有可能的多糖进行排序和打分。排序机制基于对多糖分数的计算,该分数是一个数值,代表多糖的实验属性(组成和分支类型)与数据库中多糖的属性的接近程度。
SimGlycan多糖质谱数据分析软件

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