北京天演融智软件有限公司

第11年
4006816680转427
Sequencher  DNA 序列分析软件

Sequencher DNA 序列分析软件

参考价格:¥37976.00
产品型号:Sequencher
适用范围:高教
所在地区:华北 北京
应用院校:中国科学院,北京市疾病预防控制中心,四川疾病预防控制中心,广东省疾病预防控制中心,云南省疾病预防控制中心,中国疾病预防控制中心,陕西省疾病预防控制中心,上海交通大学医学院附属瑞金医院,南京农业大学,山西农业大学,黑龙江疾病控制中心
上架时间:2017-11-16
留言咨询
4006816680-427  QQ交谈
与企业取得联系时请告知该信息获取自中国教育装备采购网
我要分享
详细说明

Sequencher  DNA 序列分析软件

以上价格不是最终报价,如需本款软件的最终价格,请留言咨询 ,我们将尽快给您报价。

Sequencher是DNA序列分析的工业标准软件。它可以和所有的自动序列分析仪一同工作,并且因为它的极速Contig组装、很短的学习曲线、用户友好的编辑工具,以及卓越的技术支持而众所周知。从差不多15年前释出第一个版本到现在,Sequencher在 每个基因专业和制药公司中都应用与于序列分析任务,同时在全球超过40个国家里为数众多的学术和政府实验室中使用。Sequencher被生命科学研究 者们使用于许多不同的DNA序列分析应用方面,包括基因重组、突变检测、法医的人体辨别,以及分类学等等...

Sequencher的能力包括杂合子和SNP的检测和分析,cDNA到染色体DNA的大型间隙对准,比较排序,对置信评分的支持、ORF转换、基因银行特性化导入、以及限制酶映射等等。

Sequencher产品特性:
SNP检测(SNPDetection)
序列装配(SequenceAssembly)
序列编辑(SequenceEditing)
自动分析(AutomatedAnalysis)
矢量微调(VectorTrimming)

SNP检测
使用Sequencher来进行比较对准以便鉴别和报告SNP以及突变。
例如,调用第二峰..功能分析你的所有序列以寻找潜在的杂合子。你可以控制定义一个杂合子的严格度。
你可以从一个杂合子跳到下一个,而仅仅需要在BaseView里面按一下空格键。你还可以观察一致及其参考序列的转换。
序列装配

Sequencher的装配算法可以将你的DNA片断快速而又准确的装配起来。自觉的工具允许你在数秒内就可以设置好参数并且调整它们。
你完全可以不顾方向的装配序列。Sequencher会比较前端和反转补体方向来装配最可能的Contig。
将Sequencher的多功能装配工具应用到:
确定矢量构造
装配病毒和细菌基因组
从cDNA库中聚类数以万计的序列
将基因变体和一个参考序列做对比
创建一个引物地图
将cDNA装配成基因组序列
以及其他许多项目...

序列编辑
Sequencher能够给你足够的信心认为一个序列是绝对正确的。你可以只观察一个序列的色谱图,你也可以从前端或反方向同时查看多个对齐的色谱图。在你的已对齐数据中滚动是很容易的。你可以使用Sequencher的选择工具来高亮不一致或者低质量的区域。

自动分析
Sequencher可对你的数据进行批处理,这个过程是透明、用户可定义、可恢复的,并且Sequencher从不为了自动化的目的而破坏你科学结论的正确性。
当你工作在多个序列时,Sequencher可以:
调用第二峰
调整矢量
调整低质量的尾端
创建一致序列
恢复到实验数据

Sequencher总是管理两份数据,一份编辑过的,一份则是原始的导入数据。当你应用“ReverttoExperimentalData”命令到在你项目中已选定的序列或者在一序列中的选中部分时,你可以撤销所有或者部分编辑动作。

自 从4.5以后,Sequencher就包含了一个新的自动化工具,“AssemblebyName”。依靠 “AssemblebyName”,你可以选择片段名的一部分作为一个共享的标识符,或者说是“装配句柄”。Sequencher就可以将选择和名 字自动转换为Contig。例如,仅仅通过一个按钮的点击,你就可以将90个文件,45对前端和反向序列转换成45个根据你的病人编号命名 的Contig。装配参数的每个变化都会重组你的片段,因此你可以根据克隆编号、日期、引物,或者其他任何你记录在序列名称中的特征,来装 配Contig。

如果你做了许多排序,你会感激“AssemblebyName”,尤其是在你有许多个带有一个标准引物集的样本序列时。事实上,任何在序列名中具有可用信息人的人,都有可能使用“AssemblebyName”。一些应用包括:
用于身份鉴定和人口研究的MHC和线粒体基因排序。
候选基因的PCR产品的分析。
对保存的跨系统分类物种基因的排序。
通过跟踪病毒对抗病毒剂或疫苗的抗药性,对病毒序列进行监控。

即 使在项目中只有一个Contig,“AssemblebyName”仍然是有用的,因为它确保Contig的名称可以精确的表述样本的名称。如 果你有命名为“Bob”的样本,那么正确命名你的Contig并不是什么难事,但但你有象“Bob-2309888762-4321”这样更复杂的名 字时,允许Sequencher命名你的Contig是非常有用的。

矢量调整
自动排序器以基础调用错误生成结 果。从DNA库克隆的序列通常包括矢量序列、polyA尾,或其他不相关序列。内含子和引物序列通常会和放大的外显子序列侧面相连。不调整的话,这 些污染物会扭曲你的装配和下游分析。Sequencher允许你调整低质量或者含糊的数据。“TrimEnds”将令人误解的数据从序列片段的尾部 去除。“TrimVector”将污染序列尾部的特定序列数据移除。“TrimtoReference”剔除超出装配参考序列的序列尾部。