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PRIMER |生态学数据分析软件

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PRIMER
生态学数据分析软件
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北京
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数以千计的研究人员信赖PRIMER在多变量分析中的独创性和清晰度。

分析可行安全的非参数方法中受益的生态数据或任何其他数据

PRIMER大量用于生态学数据的处理,它是一套稳健,广泛适用的多变量数据的统计分析包,特别是物种组合,理化变量,基因,微生物,生物指标,饮食,RS,建模等数据。

PRIMER V7提供了广泛的单变量,图形和多变量例程从社区生态学分析物种逐样本数据的数组。数据通常丰度,生物量,%面积(或线)的覆盖,存在/不存在等。并在环境影响的生物监测和更基础的生态研究中出现。还照顾物理值和化学浓度的矩阵,其本身或生物组合数据并行分析,例如,以检查生物变化与物理化学条件的共同变化。

尽管对于生物组合数据分析要求是一个原理焦点,所述包装是同样适用,其是多变量或可被视为这样的其他数据结构。

统一特征是数据集可以是根据他们的组合,生物标记套件,粒度分布,生长曲线的形状等,将每个样本对的形式简化为适当的三角矩阵,然后聚类和排序能够显示样本之间的关系,和排列测试用于检验假设。

PRIMER V7的特有特征是能够基于分类的不同或亲缘物种组成计算生物多样式指数。这些例程允许正式的假设测试在一个地点(按物种列表的分类“宽度”的平均和变化),从一个更大的区域物种中“预期”的变化。V7提供了一种可能的方法,当取样工作不受控制时,将生物多样性模式与广泛的空间和时间尺度进行比较。

强大的

这些方法很少假设数据的形式。非度量排序和置换测试是该方法的基础,该方法易于实现且易于解释。

广泛适用

对方法的解释性和透明度的信息解释了为什么在海洋,陆地和淡水生态学,林业,土壤科学,遗传学,水产养殖,分类学,微生物学,医学,经济学等领域采用PRIMER。

轻松操作数据和结果

PRIMER工作区(*.pwk)

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在单个交互式和直观的图形Windows环境中同时处理多个数据集,图形和输出文件。

使用树状导航窗格轻松跟踪所有工作

输入/输出来自Excel,.csv,.txt或3列格式的数据

在屏幕上查看和更改绘图和图形的颜色,字体,外观和感觉

复制/打印/导出结果为.jpg,.emf,.tif,.gif,.png,.bmp,.rtf文件

指定分析的能力和灵活性

确定样本或变量的重要子集

定义测试和显示的组结构

处理相对较大的数据集(可用的Windows内存)

合并或CIA分指定条件的数据

释放内置向导的省时功能,用于矩阵显示和核心分析

排序

用于可视化数据,包括主成分分析(PCA)技术协调,加上非十进制,度量或阈值度量的多维度(NMDS,MMDS,tmMDS)。在二维或三维可视化高维数据。自定义文本,颜色和符号。使用叠加层添加基本信息,例如群集,轨迹,气泡,图像,矢量或生成树。

使用bootstrapping在MDS图上显示置信区域。旋转,展开,旋转,动画,保存和分享您富有洞察力的图像。

聚类

执行分级聚类成样品基团,具有单,完整,组平均的或柔性的-β键选项。

创建通表象距离矩阵和情节树状图。自定义,旋转,放大或打印出来多个页面来捕获所有的细节,相似的配置文件(SIMPROF)和相关的排列检验鉴定样品或物种群的一致性,分裂聚类方法可以是不受约束的(UNCTREE),或受环境变量约束,而krCLUSTER执行非均衡版本的k均值聚类。

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阴影图和热图

使用选择的灰度或色谱以2d或3d显示实际值。

凸图案露出自如。样品和变量可以根据不同的标准,包括梯度,聚类约束或分组进行排序。

标签和读好易于球盖和定制。

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非参数测试

基于排雷的假设检验使用相似性分析(ANOSIM),测试来自不同的时间,位置,试验处理等多变量样本组之间的差异。PRIMER的算法现在支持这些完全非参数测试的大多数三向设计。确定物种主要提供两组样品。之间的辨别为系列化,在时间和空间上连续的数据的其它曼特尔型试验。

相关矩阵彼此或识别的,他们一起产生的变量的子集与给定相似度矩阵匹配的Mantel类型匹配。

置换测试包括可变的选择步骤,以确保严格的统计推断。

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生物多样性分析

使用分类学,功能和系统发育信息来为生物多样性评估提供信息。测试范睢使用子采样算法主名单。

计算经典和新颖的多样指数或单个变量的汇总统计的众多,具有聚合工具在更高分类级别分析数据,访问的灵活绘图功能,广泛的选择。变量:线,柱状图,散射,框,装置,表面或曲线绘图员特定生态学的工具是在之间,诸如显性图,几何类情节,或丰度的生长量曲线。

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