按照BSL-2标准建造的实验室，也称为基础生物实验室。在建筑物中实验室无需与一般区域隔离。实验室人员需经一般生物专业训练。其具体标准微生物操作、特殊操作、安全设备、实验室设施要求如下。
2.1标准操作
工作一般在桌面上进行,采用微生物的常规操作和特殊操作。
工作区内禁止吃、喝、抽烟、用手接触隐形眼镜和使用化妆品。食物贮藏在专门设计的工作区外的柜内或冰箱内。
使用移液管吸取液体，禁止用嘴吸取。
操作传染性材料后要洗手，离开实验室前脱掉手套并洗手。
制定对利器的安全操作对策。
所有操作均须小心，以减少实验材料外溢、飞溅、产生气溶胶。
每天完成实验后对工作台面进行消毒。实验材料溅出时，要用有效的消毒剂消毒。
所有培养物和废弃物在处理前都要用高压蒸汽灭菌器消毒。消毒后的物品要放入牢固不漏的容器内，按照国家法规进行包装，密闭传出处理。
昆虫和啮齿类动物的控制应参照其它有关规定进行。
妥善保管菌、毒种，使用要经负责人批准并登记使用量。
2.2特殊操作
操作传染性材料的人员，由负责人指定。一般情况下受感染概率增加或受感染后后果严重的人不允许进入实验室。例如免疫功能低下或缺陷的人受感染危险增加。
负责人要告知工作人员工作中的潜在危险和所需的防护措施(如免疫接种)，否则不能进入实验室工作。
操作病原微生物期间，在实验室入口必须标记生物危险信号，其内容包括微生物种类、生物安全水平、是否需要免疫接种、研究者的姓名和电话号码、进入人员必须佩戴的防护器具、遵守退出实验室的程序。
实验室人员需操作某些人畜共患病病原体时应接受相应的疫苗免疫或检测试验(如狂犬病疫苗和TB皮肤试验)。
应收集和保存实验室人员和其他受威胁人的基础血清，进行试验病原微生物抗体水平的测定，以后定期或不定期收取血清样本进行监测。
实验室负责人应制定具体的生物安全规则和标准操作程序,或制定实验室特殊的安全手册。
实验室负责人对实验人员和辅助人员要进行针对性的生物危害防护的专业训练,定期培训。必须防止微生物暴露、学会评价暴露危害的方法。
必须高度重视污染利器包括针头、注射器、玻璃片、吸管、毛细管和手术刀的安全对策。
培养物、组织或体液标本的收集、处理、加工、储存、运输过程，应放在防漏的容器内进行。
操作传染性材料后，应对使用的仪器表面和工作台面进行有效的消毒，特别发生传染性材料外溢、溅出，或其它污染时更要严格消毒。污染的仪器在送出设施检修、打包、运输之前都要给予消毒。
发生传染性材料溅出或其它事故要立即报告负责人，负责人要进行恰当的危害评价、监督、处理，并记录存档。
非本实验所需动物不允许进入实验室。
2.3安全设备(初级防护屏障)
实验室内工作必需穿防护工作服。离开实验室到非工作区(如餐厅、图书室和办公室)之前要脱掉工作服。所有工作服或在实验室处理或由洗衣房清洗，不准带回家。
可能接触传染性材料和接触污染表面时要戴乳胶手套。完成传染性材料工作之后需经过消毒处理，方可脱掉手套。待处理的手套不能接触清洁表面(微机键盘、电话等)，不能丢弃至实验室外面。脱掉手套后要洗手。如果手套破损，先消毒后脱掉。
能产生传染物外溢、溅出和气溶胶的操作，包括离心、研磨、搅拌、强力震荡混合、超声波破碎、打开装有传染性材料的容器、动物鼻腔注射、收取感染动物和孵化卵的组织等，都要使用Ⅱ级生物安全柜和物理防护设备。
离心高浓度和大容量的传染性材料时，如果使用密闭转头、带有安全帽的离心机可在开放的实验室内进行，否则只能在生物安全柜内进行。
当操作(微生物)得不在安全柜外面进行时，采取严格的面部安全防护措施(镜、口罩、面罩或其它设施)并防止气溶胶发生。
2.4实验室设施(次级屏障)
设施门要加锁，限制人员进入。
实验设施地点离开公共区。
每个实验室设一个洗手池。要求设置非手动或自动开关。
实验室结构要便于清洁卫生，禁止使用地毯和垫子。
工作台面不渗水，应耐酸、碱、耐热和有机溶剂等。
实验室家具应预先设计，便于摆放和使用，表面应便于消毒，并在其间留有空隙便于清洁。
生物安全柜的安装，室内的送、排风要符合物理防护参数要求。远离门口、风口和能开的窗户，远离室内人员经常走动的地方，远离其它可能干扰的仪器，以保证生物安全柜的气流参数和物理防护功能。
建立冲洗眼睛的紧急救护点。
照明适合于室内一切活动，避免反射和耀眼，以免干扰视线。
只要求一般舒适空调，没有特殊通风要求。但是，新设施应该考虑机械通风系统能够提供通向室内的单向气流。如果有通向室外的窗户，必须安装纱窗。
