为了使洁净室工作达到一定的标准，洁净室的运行必须满足下述准则的要求：
1、洁净室的送风量充足，足以稀释或消除室内产生的污染。
2、洁净室内的空气是从洁净区向洁净程度差的区域流动，受污染空气的流动达到最低程度，空气在门口处和室内建筑中的流动方向正确。
3、洁净室的送风不会显著增加室内的污染。
4、室内空气的运动状态可保证密室内没有高浓度聚集区域。
如果洁净室达到了上述这些准则的要求，就可以测量其粒子浓度或微生物浓度，以确定其达到了规定的洁净室标准。
洁净室的测试：
1、送风量与排风量：如果是紊流洁净室，那么就要测量其送风量与排风量。若为单向流洁净室，则要测量其风速。
2、各区之间的气流控制：为证明各区之间气流运动方向正确，也就是从洁净区向洁净度差的区域流动，必须检测：
(1)各区间的压差正确;
(2)门口处或墙、地板等处的开口处气流运动方向正确，即从洁净区向洁净程度差的区域流动。
3、过滤器检漏：对高效过滤器及其外框要进行检验，以保证悬浮污染物不会穿过：
(1)损坏了的过滤器;
(2)过滤器与其外框间的缝隙;
(3)过滤器装置的其他部位而侵入室内。
4、隔离检漏：这项测试是为了证明悬浮污染物不穿过建筑材料侵入洁净室。
5、室内气流控制：气流控制测试的类型要依洁净室的气流模式—是紊流还是单向流而定。若洁净室气流为紊流，则必须验明室内没有气流运行不足的区域。若是单向流洁净室，则必须验明整个室内的风速和风向是符合设计要求的。
6、悬浮粒子浓度和微生物浓度：如果上述这些测试满足要求，则最后对粒子浓度和微生物浓度(需要时)进行测量，以便验明其符合洁净室设计的技术条件。
7、其他测试：除了上述这些污染控制方面的测试以外，有时还必须进行下述一项或若干项测试：温度、相对湿度、室内加热与冷却容量、噪声值、光照度、振动值。
