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RNA提取常见问题及注意事项

教育装备采购网 2018-11-07 11:47 围观21724次


  1.RNA在细胞内极易降解,样本选择时一定要选取新鲜的样本组织或者取样后迅速低温处理(液氮速冻);样本出现多次反复冻融后,RNA得率会严重下降,也会导致RNA降解;RNA提取环境要保持无RNA酶污染;

  2.RNA容易受到环境污染导致RNA严重降解,建议实验过程中注意更换实验手套,使用所有耗材应该均无RNA酶的一次性耗材;

  3.试剂盒中BufferEB(RNA专用)中含有少量EDTA,可能影响下游实验,使用时适当稀释,如果用其他洗脱液洗脱,要确保PH>7.5,PH过低影响洗脱效率;

  4.离心柱漂洗完成后,尽可能烘干柱膜上残留乙醇,残留乙醇会影响洗脱效率和下游实验效果;柱膜也不建议过度干燥,没有乙醇味道残留最好,如果过度干燥可能影响RNA溶解;如果A260/230值过低,说明样本提取过程中漂洗不彻底,有盐离子残留,建议增加漂洗次数;

  5.对于RNA提取,A260/280<1.9说明有可能存在DNA污染或者蛋白污染,如果洗脱样本时没有使用BufferEB,而使用ddH20(确保无RNA酶),比值或偏低,因为Ph值会影响吸光值,并不表示样本纯度低;

  6.如果提取的样本RNA发生严重降解,可能是由于裂解液没能完全灭活样本中RNA酶,建议增加裂解液使用量(具体参见说明书)或者降低样本初始量;

  7.RNA完整性可以通过超微量核酸检测仪检测或者琼脂糖凝胶电泳(电泳条件:胶浓度1%;1XTAE电泳缓冲液)来判断;一般样本RNA电泳条带为两条带,对于植物样本,有可能存在叶绿体RNA干扰,条带数量大于4条,并不表示RNA提取发生降解;

  8.电泳环境受到RNA酶污染,也会造成RNA降解,电泳检测不准确,确保电泳过程中电泳缓冲液,上样缓冲液无RNA酶污染;

  9.RNA提取一般是传统TRIzol方法和改进的柱式方法;对于TRIzol法进本可以提取大部分样本RNA,但是对于多糖多酚植物样本,建议使用者尽量选择具有针对性的试剂盒(参见目录),传统TRIzol法无法有效去除多糖多酚这些次生代谢物;

  10.对于植物样本,样本处理量无法统一确定,对于一般样本(烟草,拟南芥等),提取量不超过100mg鲜重组织或者20mg干重组织,对于复杂样本(水稻,玉米,榆树等),建议初始样本量不超过50mg鲜重或者10mg干重组织;如果需要较高的RNA量,可以采取多管浓缩的方法提取RNA;

  11.对于植物样本,如果离心时堵塞离心柱,建议减少初始样本量;

  12.对于血液样本,如果样本中含有血块,说明样本收集时未加入血液抗凝剂;建议重新收集样本并加入EDTA,肝素,柠檬酸等抗凝剂;

  13.RNA浓度及纯度判断:[RNA]μg/ml=A260 x稀释倍数x40.0 (40.0:RNA的平均吸收系数);

  14.参考电泳图:(电泳图来源:使用者使用本公司SN0306AD提取梨果肉RNA电泳图)

  

点击进入北京翔悦环宇科技发展有限公司展台查看更多 来源:教育装备采购网 作者:北京翔悦环宇科技发展有限公司 责任编辑:张肖 我要投稿
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