长期以来，东南大学积极打造“课堂体育教学、课外体育活动、多种体育赛事、多样体育文化、新型体育方法”五位一体体育教育工作模式，成效显著，学校也连续八次被国家体育总局授予“全国群众体育先进单位”荣誉称号。
体育课程覆盖各类学生。面向全体学生开设三种类型体育课程。对普通学生开设自主选择上课时间、运动项目和教师的“三自课程”;对身体病弱的学生开设专门的保健体育课;为体育特长生开设专项提高课。在教学过程实行了教师与学生、体育课堂与网络课程、课内与课外的“三互动”，切实提高课堂教学效果。
体育活动贯穿各个阶段。一年级开展早锻炼活动，培养新生体育锻炼习惯;二年级开展涉及22个项目38个不同等级兴趣类和技能类体育活动项目;三、四年级实施由院系体育老师负责考核的每周三次的课外活动和《国家学生体质健康标准》测试;面向研究生开展兴趣类轻型体育培训和快乐健身比赛活动。
体育赛事覆盖各个时节。以校学生田径运动会、校研究生轻运动会、各院系运动会等三大竞技比赛为龙头;以春季定向比赛、夏季啦啦操比赛、秋季拔河比赛和冬季万人长跑比赛等四大趣味比赛为主体;以学生体育社团举办的“新生杯”和“院系杯”八大球类联赛为辅助，形成了月月有安排、周周有比赛、年均20万人次参与其中的体育运动竞赛体系。
丰富校园体育文化氛围。以体育名人进校园、体育文化节等形式推广体育竞技文化和普及体育运动知识。先后邀请著名排球教练郎平、知名篮球运动员胡卫东、资深足球评论员张路、武术世界冠军李菲、美国体育科学院朱为模院士等来校交流;宣传在校生郝运力夺伦敦奥运会奖牌的优秀事迹，开展阳光伙伴体育文化节等活动，传播热爱体育、崇尚运动、健康向上的体育文化，切实丰富校园文化氛围。
创新体育工作方法。紧扣WEB2.0时代手机APP应用广泛深入学生日常生活的特征，推广“微健康”手机APP，通过测试并记录心率来引导广大学生积极参与“紧抓微时间、借助微工具、利用微空间、进行微运动、达到微健康”的“五微模式”体育锻炼项目，使学生在轻松的氛围中形成日常锻炼习惯。
