丽水市林业科学研究院立足丽水开展科技创新，以林下食用菌、林源中药材、林地干水果、林木新品种为重点，形成了自己的品牌和特色。自2001年丽水撤地设市以来，先后主持完成科技成果36项，其中获得省科学技术奖三等奖5项、市科技进步一等奖4项，主要参加成果获得省科学技术二等奖5项。选育了处红柚等国家、省级林木良种3个、香菇新品种2个，获国家发明专利6项，制订地方标准8个，出版专著12部，发表研究论文近100篇。
丽水市林业科学研究院是浙江省林业科学研究院丽水分院，成立了中南林科大丽水市研究生工作站，共建了浙江省丽水食用菌技术创新服务平台、浙江省丽水中药产业区域科技创新服务平台，加入了浙江省农业育种团队的野生花卉、中药材、食用菌等专项团队，牵头或联合组建了中药材、食用菌等丽水市重点科技创新团队，与市内外农业龙头企业、专业合作社、专业大户等合作共建了林菌林药复合经营、油茶香榧木本油料高效栽培等科技示范基地，每年推广林木良种苗木近百万株。
